انظر الفرع يتولى القسم مسؤولية إعداد الأطباء الأكفاء في تشخيص وعلاج مسببات الأمراض التي تسببها الكائنات الحية الدقيقة والأمراض الحديثة وتدريب الخبراء والباحثين في عزل وتشخيص وكشف الطفرات بشكل عام للجراثيم والمرشحات والطفيليات والفطريات باستخدام الطرق الحديثة التي تقاوم التطور العلمي العالمي وإيجاد حلول لهذه الأسباب باستخدام الأدوية المستخدمة. الرسالة تعزيز التعليم المتكامل مع المجالات الأساسية والسريرية الأخرى في علم الأحياء الدقيقة، وثانيًا، تنمية الثقافة ضد الأمراض الحديثة والمناعية وإسناد التخصص والبحث المشترك مع الأعضاء الآخرين داخل الكلية وخارجها وبطرق حديثة لمواكبة التقدم العلمي لتلبية احتياجات المجتمع وتحسين صحة الإنسان. الأهداف 1. إعداد وتدريب طلاب كلية الطب لمواكبة العدد المتزايد من الطلاب والتطوير المستمر للفرع. إعداد وتدريب طلاب البورد العراقي في الأمراض / الأحياء الدقيقة والمناعة السريرية، وتدريس طلاب البورد العراقي والعربي في التخصصات الأخرى (العيون، الأمراض الجلدية، المفاصل). ٣. مراجعة وتطوير المناهج الدراسية بما يلبي احتياجات المجتمع وتوقعاته، ويجعلها ملائمة وقابلة للتكيف مع الاحتياجات المتغيرة في مجال علم الأحياء الدقيقة والمناعة. ٤. إطلاق وتشجيع وتطوير بروتوكولات بحثية مبتكرة وعالية الجودة في علم الأحياء الدقيقة والمناعة. ٥. تعزيز التعاون مع أقسام التعليم العالي الأخرى في التقييم والإشراف داخل الكلية وخارجها.