وحدة التخطيط الإستراتيجي لدعم المسيرة التطويرية لجامعة المؤسس، تم تهيئة بيئة جامعية متميزة قادرة على احتضان كل المبادرات الهادفة من منسوبيها. ومن هذا المنطلق حرصت كلية الطب على إنشاء وحدة خاصة بالتخطيط الإستراتيجي، وهي تعتبر أحد الوحدات التابعة لوكالة الكلية للتطوير وتعنى بالتخطيط الاستراتيجي،وتمثل حلقة الوصل بين الكلية وقطاعات الجامعة المختلفة فيما يتعلق بالخطة الإستراتيجية، وتعمل الوحدة على وضع خطط وبرامج هادفة وبناءة تساعد على تطوير الكلية في كافة المجالات.
